那么，这样的起义运动，因何招致失败呢？原因有很多。

首先，是农民军的劣根性。

这里并没有诋毁劳苦大众的意思，只是针对那个特定的年代及特定的群体而言的。起义的主体，是面朝黄土背朝天的农民，他们没有经历过正规的军事训练，所以整支队伍毫无军纪可言。古代农民军多有自由散漫的毛病，张角的队伍自不会“免俗”。

若想要带领这一支队伍，首领必须有超越常人的魄力和人格魅力。刘邦的军队、朱元璋的军队在起义之初，都曾做过烧杀抢掠的恶行，但起义领袖是怎么处理的？及时安抚民众，及时处置罪犯，及时教化士兵。这种势头，绝不能蔓延开来，否则他们的定位就会由兵变成匪。

当农民军将屠刀伸向同为农民的同胞，那么，他们就已不再是代表农民的正义之师，而是人人得而诛之的反贼。任何起义，但凡脱离了群众，走向失败是必然的。

另一重要原因，在于汉灵帝的及时补救。

各地起义爆发，朝堂乱作一团，外戚何进被拜为大将军，镇守京师。此时皇甫嵩向汉灵帝奏疏，请求解除党锢，还天下读书人以自由。汉灵帝看完奏章后迟疑了许久，找来宦官吕强商讨对策。吕强说，倘若这些被禁锢的文人投身黄巾贼，为乌合之众出谋划策，那么反贼的势力将会愈发强大。

汉灵帝虽然是个糊涂蛋，好在他比较听话，相信了吕强所言，解除了持续十五年的党锢。从这以后，那些在阉党之祸中失意的清流派和外戚得以复用，成为剿匪的中坚力量。并且，在平定黄巾贼的过程中，此前郁郁不得志的部分官员逐渐获得了兵权。

例如，刘备的老师卢植，就在党锢解放后被复用，带着一支人马杀向黄巾贼的老巢河北。可想而知的是，如果汉灵帝没有解除党锢，那么，单凭何进和皇甫嵩，亦会独木难支。正因党锢被解除，各地人才响应官兵进行剿匪，以压倒性优势战胜了黄巾军。