1769年，朝廷翻修了年久失修的慈宁宫，饶是如此仍没有太后敢在这里居住。

据传，有个太妃也曾在慈宁宫中住过几日，不过在这一日里她发现了不少反常事件，险些被吓出病来。据这位太妃所言，她搬进来的第一天深夜，听到一阵乐器的声音。后来，她在宫墙附近看到一些宫女太监的身影，走近一看却空无一人。最让她感到害怕的是慈宁宫中的水井，这口水井早已干涸，白天向下望去仅有些杂草和碎石。不过，若在晚上观看井底，便会发现井里竟出现了水源，可水面上却倒映着一张陌生的脸……

活在当代的我们都知道，鬼怪之说纯属子虚乌有。这位太妃多半是因为心理压力太大，这才产生了幻视。况且，当时的人普遍比较愚昧，这种流言的“初始版本”或许仅是些反常现象，但经传播以后就逐渐变成了鬼怪杂谈。至于为什么慈宁宫会给宫里的女人们如此大的心理压力，多半是因为康熙早年曾将祖母的灵柩停放于此。在清宫制度中，寝宫是不得停灵的。后来的每个太后，在搬入慈宁宫时，难免会觉得这里停放过棺材，有些不吉利。

那么，慈禧的胆子比较大，为什么连她都觉得自己无法镇住慈宁宫呢？

因为在两宫太后时期，她住在长春宫中，慈安住了几天慈宁宫。慈安过世后，为了表示对慈安的尊重，慈禧便未移居慈宁宫。

此外，还有一种说法出自野史，称慈安之死是慈禧所为，慈禧担心慈安的冤魂报复自己，自然对慈宁宫敬而远之，离得越远越好。

不过，虽然慈禧没有住在慈宁宫中，但每逢大宴群臣、册封嫔妃时，她都会在这里召开大典。毕竟，在后宫之中没有比慈宁宫更庄严肃穆的场所了。