《大唐双龙传》的故事背景设定在隋朝末年，隋炀帝杨广好大喜功、内外失政，致使人心尽失，天下陷入群雄割据、烽烟四起的混乱局面 。扬州城里的两个小混混寇仲和徐子陵，在命运的安排下，意外偷得武功秘籍《长生诀》，就此踏上了波澜壮阔的江湖之路。

在修炼《长生诀》的过程中，他们结识了高丽女刺客傅君婥。傅君婥为保护两人，最终惨死于宇文化及刀下。这一事件成为双龙人生的转折点，他们悲愤交加，立志学好武功，为傅君婥报仇雪恨。此后，双龙凭借着《长生诀》的神奇功法，在江湖中历经磨难，武功日益高强，逐渐崭露头角。

寇仲，性格豪迈直爽又机智多变，对李世民的妹妹李秀宁一见钟情。为了赢得美人芳心，他投身李阀，在这个过程中，他结识了宋玉致，两人从欢喜冤家逐渐互生情愫。徐子陵则邂逅了 “慈航静斋” 圣女师妃暄，被其超凡脱俗的气质深深吸引，然而师妃暄身负圣女使命，两人的感情注定充满波折。与此同时，魔门妖女婠婠也对徐子陵纠缠不休，在一次次的较量与相处中，对他暗生情愫 。

随着剧情的推进，双龙不仅要应对江湖各大门派的纷争，还要卷入复杂的政治斗争。他们在寻找 “杨公宝库” 的过程中，历经无数艰难险阻，最终成功找到宝库，获得了 “邪帝舍利” 的部分功力。此后，寇仲凭借着 “邪帝舍利” 的功力，实力大增，争霸之心愈发强烈，他组建少帅军，与李世民逐鹿天下。而徐子陵则在江湖与朝堂之间周旋，不断提升自己的武学境界 。